蛋白質大小會影響免疫共沉澱結果嗎

2021-05-23 22:42:41 字數 3614 閱讀 2527

1樓:

這個過程簡單講就是這麼幾步: 抽蛋白 掛抗體到beads上,做成有親和力的柱子(其實所謂「柱子」就是帶有抗體的beads裝到ep管裡) 抽出來的蛋白去和柱子孵育,抗體識別的蛋白和與此蛋白互做的蛋白就掛到柱子上了 洗滌,將抗體不能結合的蛋白洗掉 洗。

免疫共沉澱的缺點

2樓:北京索萊寶科技****

(1)可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質相互作用;

(2)兩種蛋白質的結合可能不是直接結合,而可能有第三者在中間起橋樑作用;

(3)必須在實驗前**目的蛋白是什麼,以選擇最後檢測的抗體,所以,若**不正確,實驗就得不到結果,方法本身具有冒險性。

(4)靈敏度沒有親和色譜高。

免疫共沉澱:

免疫共沉澱(co-immunoprecipitation)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎的用於研究蛋白質相互作用的經典方法。是確定兩種蛋白質在完整細胞內生理性相互作用的有效方法。

免疫共沉澱的注意事項

(1) 確保共沉澱的蛋白是由所加入的抗體沉澱得到的,而並非外源非特異蛋白,單克隆抗體的使用有助於避免汙染的發生;

(2) 要確保抗體的特異性,即在不表達抗原的細胞溶解物中新增抗體後不會引起共沉澱;

(3) 確定蛋白間的相互作用是發生在細胞中,而不是由於細胞的溶解才發生的,這需要進行蛋白質的定位來確定。

3樓:▆▆▆丈

(1)可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質相互作用;

(2)兩種蛋白質的結合可能不是直接結合,而可能有第三者在中間起橋樑作用;

(3)必須在實驗前**目的蛋白是什麼,以選擇最後檢測的抗體,所以,若**不正確,實驗就得不到結果,方法本身具有冒險性。

(4)靈敏度沒有親和色譜高。

免疫共沉澱和gst pull down技術各有何優勢

4樓:匿名使用者

都是用來研究蛋白質相互作用的技術

免疫共沉澱的話蛋白質是處於天然狀態,蛋白質的相互作用可以在天然狀態下進行,可以避免認為影響,還可以分離得到天然狀態下相互作用的蛋白複合體。

但是問題是兩種蛋白質的結合可能不是直接結合,而可能有第三者在中間起橋樑作用;而且必須在實驗前**目的蛋白是什麼,以選擇最後檢測的抗體,如果抗體選錯了就沒有結果。

gst pull-down是將gst融合蛋白作為探針固化到凝膠柱上,與溶液中的目的蛋白結合。可以用來確定融合(或探針)蛋白與未知(或靶)蛋白間的新的相互作用,證實探針蛋白與已知蛋白質間可疑的相互作用。

但問題是這個方法可能會出現假陽性。也就是也許是因為電荷作用的影響造成的吸附,而不是生理性的相互作用。

免疫共沉澱定量問題求助

5樓:匿名使用者

真核生物的基因組dna以染色質的形式存在。因此,研究蛋白質與dna在染色質環境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑。染色質免疫沉澱技術(chromatin immunoprecipitation assay, chip) 是目前唯一研究體內dna與蛋白質相互作用的方法。

它的基本原理是在活細胞狀態下固定蛋白質-dna複合物,並將其隨機切斷為一定長度範圍內的染色質小片段,然後通過免疫學方法沉澱此複合體,特異性地富集目的蛋白結合的dn**段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質與dna相互作用的資訊。chip不僅可以檢測體內反式因子與dna的動態作用,還可以用來研究組蛋白的各種共價修飾與基因表達的關係。而且,chip與其他方法的結合,擴大了其應用範圍:

chip與基因晶片相結合建立的chip-on-chip方法已廣泛用於特定反式因子靶基因的高通量篩選;chip與體內足跡法相結合,用於尋找反式因子的體內結合位點;rna-chip用於研究rna在基因表達調控中的作用。由此可見,隨著chip的進一步完善,它必將會在基因表達調控研究中發揮越來越重要的作用。

染色體免疫共沉澱(chromatin immunoprecipitation,chip)是基於體內分析發展起來的方法,也稱結合位點分析法,在過去十年已經成為表觀遺傳資訊研究的主要方法。這項技術幫助研究者判斷在細胞核中基因組的某一特定位置會出現何種組蛋白修飾。chip不僅可以檢測體內反式因子與dna的動態作用,還可以用來研究組蛋白的各種共價修飾 與基因表達的關係。

近年來,這種技術得到不斷的發展和完善。採用結合微陣列技術在染色體基因表達調控區域檢查染色體活性,是深入分析癌症、心血管疾病以及**神經系統紊亂等疾病的主要通路的一種非常有效的工具。

免疫沉澱結合western blot和免疫共沉澱研究蛋白互作的區別

6樓:匿名使用者

不知道你所說的proteina / protein g 是偶聯了beads的嗎? 如果是:用來結合抗體的.

如果不是:一般用來在加入抗體之前的封閉,當然也可以用來結合抗體的.

coip中ip,ib,ha都是什麼(幫我看一下結果圖)謝謝~

7樓:學無止境

ip:immunoprecipitation 免疫沉澱(純化目的蛋白)

ib:immunoblotting 免疫印跡,即western blotting(顯示目的蛋白)

ha:帶有ha標籤的蛋白(抗ha抗體來顯示目的蛋白)input:陽性對照,就是用ip之前的裂解液做ib(排除假陽性干擾)這個實驗結果說明:

pi13蛋白與atcam蛋白之間存在相互作用。

不懂,請追問。。。希望可以幫到你。祝您順利畢業!

請教gst pull-down assay和免疫共沉澱的區別

8樓:飛鴻love巨集

gst pull-down一般指用一個帶gst標籤的重組蛋白,與目的蛋白進行孵育,最後用結合gst的beads拉下相互作用複合物。

免疫共沉澱一般是用某一蛋白的抗體,在細胞裂解液中與相應的蛋白結果,用protein a/g將抗原抗體複合物拉下,最後在拉下的複合物中檢測目的蛋白的實驗。

二者都是用於檢測蛋白相互作用的實驗。

區別是pull-down一般是驗證 體外 相互作用;免疫共沉澱一般用於檢測細胞水平的 體內 相互作用。

9樓:cofe_飛

兩者原理和操作上都有一定的區別,比如做gst pull down的蛋白要有標籤,但是做免疫共沉澱就用不到,但是做免疫共沉澱需要額外準備抗體。(當然gst蛋白也需要準備抗體,畢竟事後要做wb的)

另外兩者都可以測兩種已知蛋白是否有相互作用或利用已知蛋白去調未知蛋白。本質上沒什麼區別,根據自己的情況選擇吧。

最後一點要說的就是,co-ip比較好的一點,就是可以模擬體內互作的情況,結果更真實一點。

免疫共沉澱陰性對照的意義是什麼?

10樓:浙大阿米巴

因為要排出汙染的可能性。

比如你檢測一個兔子細胞的某種蛋白質,你沒有設定igg的對照,而操作中有非特異性蛋白質,又和你設計的抗體作用,那麼就出現了陽性結果。如果做了陰性對照,也就是igg對照,對照沒有出現陽性就說明沒有非特異性的蛋白,對照出現陽性,說明你的抗體有非特異結合的可能,需要重新開始實驗。

11樓:匿名使用者

怕你的目標蛋白能與抗體相互作用,比如說你要沉澱的蛋白跟金黃色葡萄球菌的a蛋白或補體很類似,你就無語了!

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