請教 細菌16srDNA鑑定時PCR通用引物

2021-09-16 21:14:17 字數 617 閱讀 5589

1樓:匿名使用者

傳統方法細菌做革蘭氏染色 運動性試驗 各種代謝 然後查伯傑氏細菌手冊;用分子做的話提總dna,pcr擴增16srdna全長片段,上ncbi資料庫比對,選擇近緣序列構建系統發育樹鑑定。

真菌的話主要根據形態,特別是有性型生殖形態鑑定;分子的話一般擴增its區域,比對,建樹鑑定。

1、細菌基因組提取2、特異引物擴增16srdna序列3、純化pcr產物4、dna測序獲得16srdna序列5、與資料庫中已知細菌比較獲得樣品種屬資訊6、選取近似菌種序列,構建系統發育樹

求助:細菌16srdna鑑定時pcr通用引物

2樓:匿名使用者

16s rrna基因是細菌上編碼rrna相對應的dna序列,存在於所有細菌的基因組中。

16s rrna具有高度的保守性和特異性以及該基因序列足夠長(包含約50個功能域)。隨著pcr技術的出現及核酸研究技術的不斷完善,16s rrna基因檢測技術已成為病原菌檢測和。通用引物1492r/f27,pcr後去測序,因為測序軟體的自身原因,測出來開頭的序列是雜帶不準確,如果需要16srna的全長,必須做ta克隆,就需要載體的問題了。

如果你要求鑑定菌種只到屬,完全可以用通用引物。

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