現在已經有了物種全基因組測序,該怎麼對該物種每個基因進行分析

2021-05-12 02:10:55 字數 1565 閱讀 5893

1樓:匿名使用者

這個來問題要是能夠完美回答就沒有那源麼多國內外生物學家仍在努力奮鬥了。事實上,全基因測序得到就如一本「天書」,我們還是像以前那樣,比如研究某個基因,任然要做很多實驗,各個層次的,分子的蛋白的,研究基因產物的功能結構,和別的蛋白質的關係,受什麼影響,細胞定位如何(遺傳學和分子生物學)。但是有了基因組測序的方便之處也有很多,比如我們很容易去找到這個基因所在位置,是否有突變,在生信方面可以**其結構、功能,找同源基因,系統發育樹等(生物資訊學),對於低階的模式生物,甚至可以建整個基因組、蛋白組、代謝組的網路(系統生物學),用於研究高通量資料等等。

總之,想回答這個問題,得深入學習我上面提到的學科,並研究下現在的科研文獻,才能較為全面的瞭解。不過看你想知道的深度了。

目前已完成全基因組測序的物種有哪些

2樓:

目前已完成全基bai

因組測序du的物種主要可以分類三zhi大類,模式dao物種、農作版物和經濟作物、有藥用價值權的物種。

在模式物種這塊,眾所周知的,擬南芥、果蠅、斑馬魚、小鼠、大鼠等等;

而農作物和經濟作物大概有以下:水稻、玉米、大豆、甘藍、白菜、高粱、黃瓜、西瓜、馬鈴薯、番茄、擬南芥、楊樹、麻風樹、蘋果、桃、葡萄、花生;

在藥用這塊,目前主要有一些真菌類,例如靈芝、茯苓等,以及一些藥用植物,例如丹蔘、長春花等。

3樓:匿名使用者

這太多了,數不清,可以去ncbi看看

一個物種的全基因組測序後,應該怎麼使用生物資訊學方法對其進行研究

4樓:匿名使用者

仿照別人的呀,整體描述測序情況,有趣的功能基因組分析,功能基因驗證

5樓:府高原候麥

借用生物資訊學所涉及的分析方法對基因組進行分析,研究基因的功能、結構、進化等

全基因組測序 怎麼挑選有意義突變

6樓:楊風遊

首先需要了解基因組測序的作用與意義:通過基因比對了解物種的進化與變異;分析物種的致病基因。這主要是群體遺傳學與比較基因組學的內容。

ncbi提供了不同物種的基因資訊,但提交是否完全?提交完全了是否可靠?顯然即便提交完全也不一定精確,因為不同課題組採用的物種存在地域等多種背景差異,這也是為什麼我國在人類基因組計劃完成之後還要開展「炎黃計劃」等測序工作的原因,現在華大基因又在進行青藏高原藏族人群高原適應關鍵基因的測序與研究,遺傳多型在作怪罷了。

所以無論有無資料提交到ncbi上,你的工作都將是有意義的,關鍵在於資料的比對與分析。

同時要知道全基因掃描方法許多,記得當時我們用的是abi 3730測序儀,自己測。另外樣本的需求量以及有無外來物種干擾等。要和導師多交流,瞭解導師短期與中長期的科研規劃,因為你也許接的是碩士課題,也許是博士課題的一部分前期工作,直接可以延伸到博士階段。

祝研究工作順利開展!

7樓:朝著江河走

跟性狀關聯分析一下,關聯性強再拿出來做驗證

8樓:天涯招角

優選啊。好的留下,不好的甩出。

全基因組測序的內容,全基因組測序的意義是什麼?

1998年,克萊格 凡特的塞雷拉基因組公司成立,而且宣佈將在2001年完成定序工作。隨後國際團隊也將完成工作的期限提前。2000年6月26日,塞雷拉公司的代表凡特,以及國際合作團隊的代表弗朗西斯 柯林斯 francis collins 在美國 柯林頓的陪同下發表演說,宣佈人類基因組的概要已經完成。2...

全轉錄組測序可以選近緣物種作為參考基因組嗎

轉錄組測序前,需要對物種轉錄組的大小進行評估,評估方法如下 對於有參考基因組回的物種,答可以分析基因組資訊,統計編碼基因的個數,及其鹼基數,從而估計物種轉錄組的大小,另外可以查詢相關或相近物種轉錄組研究的文獻,作為參考。對於無參考基因組的物種則只能參考相近物種的轉錄組大小。轉錄組測序所需的測序量隨研...

全基因組測序可以檢測出平衡易位嗎

平衡易位用核型分析就可以檢測了,目前的基因晶片技術還不能檢測平衡易位。人家問得是全基因組測序你們說晶片幹啥?全基因組測序通過特別的策略可以分辨平衡易位,但是成功率低,不穩定,還在科研沒有用於臨床。全基因測序檢測檢測不出平衡移位,全基因測序只能得到一大批無用的資料。這些資料有什麼用,需要基因解碼,這個...