一般實時熒光定量pcr儀定檢週期是多少

2021-05-24 15:19:26 字數 5783 閱讀 1973

1樓:南京金益柏生物科技****

這個要看你設定的迴圈數,一般就一個小時20分鐘左右,僅供參考

實時熒光定量pcr與普通pcr的區別是什麼?結果有何異同?能說明的問題是什麼?

2樓:麼破1自我

二者結果相同。都能說明生物體外的特殊dna複製的整個過程的擴增效率和溶解溫度情況。

區別:1、二者系統組成不同

熒光定量pcr儀比普通的pcr儀多了熒光訊號採集系統和計算機分析處理系統。

2、二者原理不同

熒光定量pcr實時監測與dna結合的熒光染料激發的熒光,普通ocr通過檢測插入dna中核算染料的量來測定pcr最終產物量。

3、二者反應要求不同

熒光定量pcr對擴增片段有較高的要求,一般為100-300bp,普通pcr可以擴增長點的片段。

4、二者應用不同

熒光定量pcr主要是用來定量分析和確定基因轉錄水平的,普通的pcr儀是做定性分析和擴增基因片段,定量pcr儀可以做普通pcr儀的工作,反之不行。

5、二者測量成本不同

定量pcr儀**較為昂貴,普通的基因擴增儀(pcr儀)只能夠定性地分析是否存在目標片段。但是**要低很多,而且執行成本也要低很多。

實時熒光定量pcr技術有效地解決了傳統定量只能終點檢測的侷限,實現了每一輪迴圈均檢測一次熒光訊號的強度,並記錄在電腦軟體之中,通過對每個樣品ct值的計算,根據標準曲線獲得定量結果。

3樓:匿名使用者

原理不同:熒光定量pcr實時監

測與dna結合的熒光染料激發的熒光;普通pcr通過檢測插入dna中核算染料的量來測定pcr最終產物量,一般是紫外光。

反應要求:熒光定量對擴增片段有較高的要求,一般為100-300bp;普通定量可以擴增長點的片段。如果不需要檢測產物分子量大小,熒光定量可以不進行電泳就對產物進行定量分析,普通pcr必須電泳。

結果:熒光定量可以實現精確定量,普通pcr則不行。熒光定量體現可以看到整個擴增過程,可以看到擴增效率,溶解溫度,直接得到的標準曲線等,這些是普通pcr無法實現的。

如果還不清楚建議去丁香園等**逛逛,希望可以幫到你

4樓:匿名使用者

所謂實時熒光定量pcr技術,是指在pcr反應體系中加入熒光基團,利用熒光訊號積累實時監測整個pcr程序,最後通過標準曲線對未知模板進行「定量分析」的方法。

記住,實時熒光定量是定量分析

5樓:匿名使用者

熒光pcr是為了測量mrna表達量的 普通pcr是為了擴增目的片段的

6樓:匿名使用者

熒光定量是定量的,普通pcr是定性的,結果一個是說明含有多少,另一個說明有還是沒有,前者更精確一點

實時熒光定量pcr儀有哪些種類,各有什麼特點

什麼是實時熒光定量pcr,檢測指標是什麼?

7樓:奔馬的香香豬

實時檢測pcr擴增,在擴增的指數期對起始模板進行定量,在擴增過程中,熒光訊號隨著pcr產物的增加而增強。我們實驗室使用的bioghsc super probe kit pcr實驗檢測dna,測得的迴圈數在28左右,整個pcr過程有4個階段,基線期---指數增長期---線性增長期---平臺期,指數增長期內,pcr有高度重複性,一般的檢測指標是看線性圖譜的擴增曲線的起跳值(ct值)。

8樓:錢塘書生

你要檢測什麼東西啊?

實時熒光定量pcr是檢測模板dna的拷貝數、基因表達量、基因突變等的

9樓:閱微基因

所謂實時熒光定量pcr技術,是指在pcr反應體系中加入熒光基團,利用熒光訊號積累實時監測整個pcr程序,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。參考資料:http:

熒光定量pcr儀器有哪些優缺點

10樓:摯羋汛訃

最好都有。普通的基因擴增儀(pcr儀)只能夠定性地分析是否存在目標片段。但是**要低

版很多,而權且執行成本也要低很多。不過不能直接得到擴增結果,還需要做電泳檢測。實際中檢測遺傳疾病,品種分子標記篩選,甚至親自鑑定等都可以由普通pcr儀完成。

但是,某些需要定量的實驗就必須用到實時定量pcr了。比如檢測某些病原物的數量(血液乙肝病毒複製程度),特定基因的表達量(比如結合反轉錄做的rna定量分析),某些基因在染色體組中拷貝數(以前往往使用southernblot技術)等等。熒光定量prc一般不需要對擴增產物進行電泳分析,操作相對簡單些,但是耗材實在是貴。

簡單來說,看有沒有用普通pcr儀,看有多少用熒光定量pcr

實時定量pcr的結果是怎樣分析的

11樓:小乾乾

1、如果有標準曲線,按照標準曲線計算。

2、一般都是相對量,則用delta delta ct方法來計算。

3、舉例如下:對照組基因a的ct值為20, 內參(比如βactin)ct值15。實驗組基因a ct值18,內參ct值14。

4、首先算加樣量:delta ct=15-14=1。2的1次方是2。

也就是說實驗組的加樣量是對照組的2倍。基因a: delta ct=20-18=2。

2的2次方是4。也就是說基因a的量在實驗組是對照組的4倍。但是由於加樣量是2倍,所以4處以2=2,最後的相對量是2倍。

5、幾點注意:必須確定擴增的特異性,只有相同目標的ct值才能相減(擴增效率有可能不同),2的某次方只是理論值,實際擴增效率低於2,最好不用syber green。

12樓:豆村長de草

實時熒光定量pcr技術是在pcr反應體系中加入熒光基團,利用熒光訊號積累實時監測整個pcr程序,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。

基線在pcr擴增反應的最初數個迴圈裡,熒光訊號變化不大,接近一條直線,這樣的直線即基線。光域值threshold的設定,一般將pcr反應前15個迴圈的熒光訊號作為熒光本底訊號,熒光域值是pcr3-15個迴圈熒光訊號標準差的10倍,熒光域值設定在pcr擴增的指數期。

融解曲線是用來驗證擴增產物特異性的,如果產物是單一條帶,融解曲線就會出現一尖峰;如果有引物二聚體或其它非特異性擴增,就會出現至少兩個尖峰。

擴充套件資料:

時熒光定量pcr儀real-time qpcr 常見問題分析:

1、無ct值出現

1)檢測熒光訊號的步驟有誤:一般sg法採用72℃延伸時採集,taqman法。則一般在退火結束時或延伸結束採集訊號;

2)引物或探針降解:可通過page電泳檢測其完整性;

3)模板量不足:對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;

4)模板降解:避免樣品製備中雜質的引入及反覆凍融的情況。

2、ct 值出現過晚(ct>38)

1)擴增效率低:反應條件不夠優化,設計更好的引物或探針、改用三步法 進行反應、適當降低退火溫度、增加鎂離子濃度等;

2)pcr各種反應成分的降解或加樣量不足,

3)pcr產物太長:一般採用80-150bp的產物長度。

3、標準曲線線性關係不佳

1)加樣存在誤差:使得標準品不呈梯度;

2)標準品出現降解:應避免標準品反覆凍融,或重新制備並稀釋標準品;

3)引物或探針不佳:重新設計更好的引物和探針;

4)模板中存在抑制物,或模板濃度過高。

13樓:匿名使用者

實時定量pcr的結果是可以和所有核酸結合,沒有特異性。

要保證特異性的話,最好用其他的方法。擴增體系中加入模板dna的體積,比如同時10微升的體系,對照組加1微升dna,實驗組加2微升dna,則實驗組的加樣量是對照組的2倍。

看ct值是分析熒光定量pcr最直觀的一個資料,ct值一般在35左右就失去參考價值了,平時我們實驗室用biodai-pcr熒光定量法測得的擴增曲線的起跳值基本在30左右。

擴充套件資料:

real-time qpcr 常見問題分析:

一、無ct值出現

1、檢測熒光訊號的步驟有誤:一般sg法採用72℃延伸時採集taqman法。

則一般在退火結束時或延伸結束採集訊號。

2、引物或探針降解:可通過page電泳檢測其完整性。

3、模板量不足:對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起。

4、模板降解:避免樣品製備中雜質的引入及反覆凍融的情況。

二、ct 值出現過晚(ct>38)

1、擴增效率低:反應條件不夠優化,設計更好的引物或探針、改用三步法 進行反應、適當降低退火溫度、增加鎂離子濃度等。

2、pcr各種反應成分的降解或加樣量不足。

3、pcr產物太長:一般採用80-150bp的產物長度。

三、標準曲線線性關係不佳

1、加樣存在誤差:使得標準品不呈梯度。

2、標準品出現降解:應避免標準品反覆凍融,或重新制備並稀釋標準品。

3、引物或探針不佳:重新設計更好的引物和探針。

4、模板中存在抑制物,或模板濃度過高。

四、負對照有訊號、溶解曲線不止一個主峰

1、引物設計不夠優化:應避免引物二聚體和髮夾結構的出現。

2、引物濃度不佳:適當降低引物的濃度,並注意上下游引物的濃度配比。

3、鎂離子濃度過高:適當降低鎂離子濃度,或選擇更合適的mix 試劑盒。

4、模板有基因組的汙染:rna提取過程中避免基因組dna 的引入,或通過引物設計避免非特異擴增。

五、擴增效率低

1、反應試劑中部分成分特別是熒光染料降解。

2、反應條件不夠優化:可適當降低退火溫度或改為三步擴增法。

3、反應體系中有pcr反應抑制物:一般是加入模板時所引入,應先把模板適度稀釋,再加入反應體系中,減少抑制物的影響。

14樓:寵愛認

常見分析角度:

1.無ct值出現

(1)檢測熒光訊號的步驟有誤:一般sg法採用72℃延伸時採集,taqman法則一般在退火結束時或延伸結束採集訊號;

(2)引物或探針降解:可通過page電泳檢測其完整性;

(3)模板量不足:對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;

(4)模板降解:避免樣品製備中雜質的引入及反覆凍融的情況。

2.ct 值出現過晚(ct>38)

(1)擴增效率低:反應條件不夠優化,設計更好的引物或探針、改用三步法 進行反應、適當降低退火溫度、增加鎂離子濃度等;

(2)pcr各種反應成分的降解或加樣量不足,

(3)pcr產物太長:一般採用80-150bp的產物長度。

3.標準曲線線性關係不佳

(1)加樣存在誤差:使得標準品不呈梯度;

(2)標準品出現降解:應避免標準品反覆凍融,或重新制備並稀釋標準品;

(3)引物或探針不佳:重新設計更好的引物和探針;

(4)模板中存在抑制物,或模板濃度過高。

4.負對照有訊號、溶解曲線不止一個主峰

(1)引物設計不夠優化:應避免引物二聚體和髮夾結構的出現;

(2)引物濃度不佳:適當降低引物的濃度,並注意上下游引物的濃度配比;

(3)鎂離子濃度過高:適當降低鎂離子濃度,或選擇更合適的mix 試劑盒;

(4)模板有基因組的汙染:rna提取過程中避免基因組dna 的引入,或通過引物設計避免非特異擴增。

5.擴增效率低

(1)反應試劑中部分成分特別是熒光染料降解;

(2)反應條件不夠優化:可適當降低退火溫度或改為三步擴增法;

(3)反應體系中有pcr反應抑制物:一般是加入模板時所引入,應先把模板適度稀釋,再加入反應體系中,減少抑制物的影響。

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